La Secretaría General de la Gobernación de Santander, tiene como propósito liderar el desarrollo integral del talento humano que conforma la administración central, impulsar la dinámica organizacional que permita incorporar en los procesos de la administración departamental los cambios internos y externos requeridos, propender por la custodia y conservación de los documentos y proporcionar los servicios de apoyo a la institución en materia de modernización institucional en todos los aspectos, buscando de forma permanente, las condiciones adecuadas para el cumplimiento de los propósitos institucionales.

Corresponde a la Secretaría General el desarrollo de las siguientes funciones generales:

• Desarrollar las políticas de administración que sirvan de soporte a la ejecución y el servicio institucional.
• Coordinar las acciones conducentes a garantizar la adecuada administración de los documentos públicos.
• Ejecutar las políticas trazadas por el Ministerio de Relaciones Exteriores en materias de expedición de pasaportes.
• Coordinar el desarrollo organizacional y la gestión administrativa del departamento.
• Coordinar y ejecutar de acuerdo con el programa anual de compras, la adquisición de bienes y servicios, así como el de generar estrategias para el almacenamiento, conservación y despacho de los mismo.
• Organizar y controlar el sistema de inventarios de la Gobernación.
• Evaluar periódicamente el funcionamiento de la estructura organizacional del Departamento, proponiendo los ajustes necesarios para mejorar la gestión administrativa y adaptarla a la normatividad vigente e innovaciones tecnológicas.
• Coordinar el reconocimiento de las pensiones y pasivos pensionales de los servidores públicos del Departamento en cualquiera de las modificaciones que señale la ley.
• Coordinar el reconocimiento y pago de las cesantías parciales y definitivas de los servidores públicos del Departamento.
• Liderar, coordinar, articular y organizar los programas de capacitación y asesoría que contribuyan al fortalecimiento integral de la administración departamental y por ende a los municipios.
• Liderar la comunicación y las relaciones del Gobierno Departamental con la Asamblea y la Contraloría del Departamento.